Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPS6KA4O75676 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KA4O75676 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA4O75676 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA4O75676 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA4O75676 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA4O75676 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA4O75676 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KA4O75676 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms