Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms