Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PPFIA3O75145 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA3O75145 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA3O75145 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms