Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEMFO60524 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMFO60524 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMFO60524 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMFO60524 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMFO60524 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMFO60524 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEMFO60524 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEMFO60524 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMFO60524 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMFO60524 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMFO60524 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMFO60524 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEMFO60524 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEMFO60524 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEMFO60524 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEMFO60524 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEMFO60524 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEMFO60524 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEMFO60524 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEMFO60524 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEMFO60524 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEMFO60524 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEMFO60524 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEMFO60524 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms