Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B3O60423 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B3O60423 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms