Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BUD23O43709 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BUD23O43709 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BUD23O43709 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BUD23O43709 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BUD23O43709 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BUD23O43709 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BUD23O43709 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BUD23O43709 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BUD23O43709 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BUD23O43709 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms