Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID2O43424 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID2O43424 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID2O43424 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID2O43424 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRID2O43424 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID2O43424 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID2O43424 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID2O43424 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID2O43424 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID2O43424 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID2O43424 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID2O43424 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRID2O43424 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID2O43424 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID2O43424 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID2O43424 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID2O43424 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRID2O43424 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRID2O43424 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRID2O43424 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID2O43424 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID2O43424 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID2O43424 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID2O43424 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID2O43424 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms