Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGSM2O43147 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SGSM2O43147 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms