Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTLC1O15269 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms