Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GNPATO15228 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GNPATO15228 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GNPATO15228 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPATO15228 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPATO15228 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPATO15228 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPATO15228 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GNPATO15228 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GNPATO15228 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNPATO15228 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GNPATO15228 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GNPATO15228 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPATO15228 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPATO15228 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPATO15228 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPATO15228 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GNPATO15228 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GNPATO15228 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GNPATO15228 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPATO15228 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPATO15228 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPATO15228 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GNPATO15228 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GNPATO15228 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GNPATO15228 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNPATO15228 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNPATO15228 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GNPATO15228 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNPATO15228 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNPATO15228 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNPATO15228 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNPATO15228 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GNPATO15228 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms