Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX3O15119 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TBX3O15119 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBX3O15119 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBX3O15119 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TBX3O15119 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX3O15119 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX3O15119 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX3O15119 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX3O15119 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX3O15119 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX3O15119 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX3O15119 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX3O15119 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX3O15119 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX3O15119 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX3O15119 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX3O15119 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX3O15119 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX3O15119 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX3O15119 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX3O15119 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX3O15119 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX3O15119 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX3O15119 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX3O15119 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX3O15119 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms