Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR4O00206 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR4O00206 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR4O00206 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR4O00206 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR4O00206 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLR4O00206 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLR4O00206 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR4O00206 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR4O00206 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR4O00206 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR4O00206 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR4O00206 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR4O00206 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR4O00206 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR4O00206 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR4O00206 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR4O00206 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms