Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
J3KT08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
J3KT08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
J3KT08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
J3KT08 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
J3KT08 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
J3KT08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
J3KT08 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms