Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNX3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNX3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNX3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNX3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNX3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNX3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNX3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNX3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNX3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BNX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms