Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRDCB7Z8K6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms