Protein–RNA interactions for Protein: B3GLJ2

PATE3, Prostate and testis expressed protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE3B3GLJ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE3B3GLJ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE3B3GLJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE3B3GLJ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE3B3GLJ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE3B3GLJ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATE3B3GLJ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE3B3GLJ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE3B3GLJ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms