Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYSRT1A8MQ03 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYSRT1A8MQ03 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms