Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRCP1A6NGW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRCP1A6NGW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRCP1A6NGW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
STRCP1A6NGW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
STRCP1A6NGW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
STRCP1A6NGW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms