Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSDA5PKW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSDA5PKW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSDA5PKW4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms