Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A4D1N5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4D1N5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A4D1N5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4D1N5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4D1N5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4D1N5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4D1N5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4D1N5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms