Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMX2A2RU54 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms