Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC26A0AVF1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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