Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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