Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms