Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CARD11Q9BXL7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms