Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms