Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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