Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms