Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DUX4L9Q6RFH8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms