Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPPQ6IPU0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms