Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWISTNBQ3B726 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms