Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCAPHQ15003 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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