Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SLC10A1Q14973 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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