Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms