Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms