Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms