Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms