Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms