Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSCP56915 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSCP56915 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms