Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC3P51654 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms