Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TNNI2P48788 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNI2P48788 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNI2P48788 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNI2P48788 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNNI2P48788 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms