Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCLMP48507 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.2 ms