Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms