Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD10P28358 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms