Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGB6P18564 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ITGB6P18564 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ITGB6P18564 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ITGB6P18564 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ITGB6P18564 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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