Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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