Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms