Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms