Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms