Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP2C9P11712 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms